SFTP significa SSH File Transfer Protocol y permite la transferencia de archivos de manera segura. Es parte de la suite del protocolo SSH y comparte el mismo puerto, 22. Si está configurado de tal manera puedes conectarte con el comando sftp <username>@<hostname>. Una vez logueado, puedes usar comandos como get <filename> y put <filename> para descargar y subir archivos.
SFTP no debe ser confundido con FTPS (File Transfer Protocol Secure).